zu 1.
Einfach die Dateinamen vorn um die Titelnummer im Verzeichnis erweitern:
01 Leerzeichen Titelbezeichnung usw.
02 Leerzeichen Titelbezeichnung usw.
.
.
10 Leerzeichen Titelbezeichnung usw.
11 Leerzeichen Titelbezeichnung usw.
usw.
zu 2.
Den Album-Tag hast du auch mit dem Albumnamen unterschiedlich belegt?
Titel im gleichen Verzeichnis müssen den genau gleichen Album-Tag haben. In anderen Verzeichnissen bei gleichen Interpreten z.B. Album CD1... Album CD2 usw.
Außerdem die Unterverzeichnisnamen wie CD1, CD2 usw. mit längerem Namen: Album CD1... Album CD2 benennen.
zu 3.
siehe 2.
Es gibt MP3-Dateien die sind irgendwie zickig, melden einen Schreibschutz usw.
Programm MP3Tag verwenden. Scheint gut zu funktionieren.
Sonst nochmal von CD rippen und neu versuchen.